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大豆胞囊线虫染色体水平基因组序列组装成功

放大字体  缩小字体 时间:2019-11-26 09:24 来源:中国科学报 作者: 宇天行   原文:
核心提示:近日,从河南省农科院传来消息,该院经济作物研究所研究员卢为国带领团队在大豆胞囊线虫研究领域获得新进展,在国际上首次将大豆胞囊线虫的基因组序列组装到染色体水平。该研究成果发表在《分子生态资源》上,练云博士为文章第一作者。
  本报讯 近日,从河南农科院传来消息,该院经济作物研究所研究员卢为国带领团队在大豆胞囊线虫研究领域获得新进展,在国际上首次将大豆胞囊线虫的基因组序列组装到染色体水平。该研究成果发表在《分子生态资源》上,练云博士为文章第一作者。

  课题组发现,黄淮地区大豆胞囊线虫发生普遍,而且出现了具有超强致病力的新小种X12。该小种能够侵染目前世界上几乎所有的优异抗病资源,目前的已知抗源对X12均没有抗病能力。深入研究该小种的基因组信息,有助于进一步了解大豆胞囊线虫的致病机制,培育抗病品种。

  通过研究,课题组揭示了具有超强致病力的大豆胞囊线虫新小种X12的基因组序列信息,并成功将其组装到9条染色体上,注释了基因组79.0%的同源序列,使基因组组装达到染色体水平,基因组挂载率为91.2%。该高质量的X12基因组数据对研究大豆胞囊线虫—大豆互作及共进化、线虫生物学和防御SCN策略有重要参考价值。
  相关论文信息:https://doi.org/10.1111/1755-0998.13068
日期:2019-11-26
 
 地区: 中国 河南
 行业: 食品检测 粮油
 标签: 河南 农科院 基因 大豆
 
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